简介：Werecentlyreportedtheuseofagene-trappingapproachtoisolatecellclonesinwhichareportergenehadintegratedintogenesmodulatedbyT-cellactivation.WehavenowtestedapanelofclonesfromthatreportandidentifiedtheonethatrespondstoavarietyofG-proteincoupledreceptors(GPCR).TheβlactamasetaggedEGR-3JurkatcellwasusedtodissectspecificGPCRsignalinginvivo.ThreeGPCRswerestudied,includingthechemokinereceptorCXCR4(Gicoupled)thatwasendogenouslyexpressed,theplateletactivationfactor(PAF)receptor(Gq-coupled),andβ2adrenergicreceptor(Gs-coupled)thatwasbothstablytransfected.Agonistsforeachreceptoractivatedtranscriptionoftheβ-lactamasetaggedEGR-3gene.InductionofEGR-3throughCXCR4wasblockedbypertussistoxinandPD58059,aspecificinhibitorofMEK(MAPK/ERKkinase).NeitheroftheseinhibitorsblockedisoproterenolorPAF-mediatedactivationofEGR-3.Conversely,β2-andPAF-mediatedEGR-3activationwasblockedbythep38,specificinhibitorSB580.Inaddition,bothβ2-andPAF-mediatedEGR-3activationcouldbesynergisticallyactivatedbyCXCR4activation.ThiscombinedresultindicatesthatEGR-3canbeactivatedthroughdistinctsignaltransductionpathwaysbydifferentGPCRsandthatsignalscanbeintegratedandamplifiedtoefficientlytunethelevelofactivation.

简介：G-proteincoupledreceptors(GPCRs)representoneofthemostimportantclassesofdrugtargetsforpharmaceuticalindustryandplayimportantrolesincellularsignaltransduction.PredictingthecouplingspecificityofGPCRstoG-proteinsisvitalforfurtherunderstandingthemechanismofsignaltransductionandthefunctionofthereceptorswithinacell,whichcanprovidenewcluesforpharmaceuticalresearchanddevelopment.Inthisstudy,thefeaturesofaminoacidcompositionsandphysiochemicalpropertiesofthefull-lengthGPCRsequenceshavebeenanalyzedandextracted.Basedonthesefeatures,classifiershavebeendevelopedtopredictthecouplingspecificityofGPCRstoG-proteinsusingsupportvectormachines.Thetestingresultsshowthatthismethodcouldobtainbetterpredictionaccuracy.

简介：组蛋白甲基化是参予细胞的过程的一个多样的数组的重要epigenetic现象并且被发现了与癌症被联系。几的Recentidentification嘘一demethylases证明了那嘘一甲基化是一个可逆过程。通过一条候选人途径，我们化学上有简历作为H3K27demethylase识别了JMJD3。进HeLa房间的JMJD3的Transfection引起了整齐的乙醇H3K27的特定的减小，但是没在di-和单音的甲基H3K27上有效果，或嘘H3K4和H3K9上的一离氨酸methylations。Theenzymatic活动要求JmjC域和被建议了为余因子绑定重要的保存组氨酸。试管内生物化学的实验证明那JMJD3directly催化demethylation。另外，我们发现JMJD3起来在前列腺癌症，和它的表示调整了在变形前列腺癌症是更高的。因此，我们作为能够把整齐的乙醇组从移开的ademethylase识别了JMJD3嘘一H3离氨酸27并且起来在前列腺癌症调整了。

简介：目的建立具有潮霉素(hygromycin)抗性的3T3细胞系,用于转染目的基因(pTRE-Ins-human)的ES阳性细胞克隆筛选的饲养层.方法通过脂质体转染的方法,将含有潮霉素B磷酸转移酶基因的质粒pHyg导入3T3细胞中,利用潮霉素的药物选择特性,对转染细胞进行压力筛选,并对其进行PCR鉴定.结果经500μg/ml的潮霉素压力筛选后,获得了抗性细胞克隆.抗性3T3细胞的形态和生长速度与正常3T3细胞没有差异,特异性核苷酸引物检测抗性细胞基因组DNA,可以扩增出对应的核苷酸片段.结论成功地培育了潮霉素抗性的3T3细胞,为进行目的基因(pTRE-Ins-human)转染ES细胞的阳性细胞克隆筛选奠定了基础.

简介：Circulargenomes,beingthelargestproportionofsequencedgenomes,playanimportantroleingenomeanalysis.However,traditional2Dcircularmaponlyprovidesanoverviewandannotationsofgenomebutdoesnotofferfeature-basedcomparison.Forremedyingtheseshortcomings,wedeveloped3DGenomeTuner,ahybridofcircularmapandcomparativemaptools.Itscapabilityofviewingcomparisonsbetweenmultiplecircularmapsina3Dspaceoffersgreatbenefitstothestudyofcomparativegenomics.Theprogramisfreelyavailable(underanLGPLlicence)athttp://sourceforge.net/projects/dgenometuner.

简介：混合的系kinase(MLK3)3是被肿瘤坏死因素激活的激活mitogen的蛋白质kinasekinasekinase--伪(TNF-伪)并且明确地在TNF-伪刺激上激活c6月N终端kinase(JNK)。TNF-伪由激活MLK3的机制不被知道。TNF联系受体的因素(TRAF)是被招募到TNF受体的细胞质的结束并且调停的改编者分子，包括JNK的激活下游的发信号。这里，我们报导MLK3与TRAF2，TRAF5和TRAF6联系；然而，仅仅TRAF2能显著地导致MLK3的kinase活动。到TRAF领域并且为到它的C终端一半(氨基酸511-847)的MLK3的TRAF2地图的相互作用领域。与对方一起的内长的TRAF2和响应以一种时间依赖者方式的TNF-伪处理的MLK3伙伴。在MLK3和TRAF2之间的协会调停有绑在MLK3的TRAF2删除异种的MLK3激活和竞争以一种剂量依赖者方式稀释MLK3kinase活动，在TNF-伪处理上。而且MLK3的下游的目标，JNK被TNF-伪以一种TRAF2依赖的方式激活。因此，我们在TRAF2和MLK3之间的直接相互作用为TNF-伪-被要求的数据表演导致了MLK3和它的下游的目标的激活，JNK。

简介：在胸腺的中央忍耐是为删除汽车的主要机制反应T房间。尽管有这，进圆周的自我反应的T淋巴细胞的逃跑揭示汽车免疫的威胁。补偿它的瑕疵，胸腺也与镇压功能生产Foxp3+CD4+CD25+规章的T房间的一个自然地发生的子集，能够控制汽车反应房间。Foxp3(叉头框P3)，为房间的这个子集的系特定的标记，对他们的thymic开发和外部功能关键，并且还Foxp3驾驶的transcriptional程序直到现在大部分未定义。新兴的证据提供了卓见进它的角色：从Foxp3到的能力与象NFAT那样的另外的抄写因素合作，到目标的染色体宽的描述，基因直接由Foxp3跳了并且调整。这里，我们讨论自然地发生的规章的T房间的发现-他们的显型，发展，维护，和功能-大部分当他们被系特定的标记定义，Foxp3。

简介：[目的]建立具有潮霉素B(hygromycinB)抗性的3T3细胞系,用于转染目的基因(pTRE2-human-Ins)的ES阳性细胞克隆筛选的饲养层。[方法]通过脂质体转染的方法,将含有潮霉素B磷酸转移酶基因(hyg)的质粒pHyg导入NIH3T3细胞中,利用潮霉素B的药物选择特性,对转染细胞进行压力筛选,并对其进行PCR和southernblot鉴定。[结果]经300ug/ml的潮霉素B压力筛选后,获得了抗性细胞克隆。抗性NIH3T3细胞的形态和生长速度与正常NIH3T3细胞没有差异,特异性核苷酸引物检测抗性细胞基因组DNA,可以扩增出相应的核苷酸片段,Southernblot鉴定结果表明潮霉素基因片段已整合入潮霉素抗性NIH3T3细胞。[结论]本实验通过脂质体介导的方法成功地培育了潮霉素B抗性的NIH3T3细胞,为进行目的基因(pTRE2-human-Ins)转染ES细胞的阳性细胞克隆筛选打下了基础。

简介：东方田鼠(Microtusfortis)分布于我国东北、西北、华中、华南17个省区,在韩国及俄罗斯也见报道.国内对该鼠的5个亚种,即指名亚种(M.f.fortis)(西北)、东北亚种(M.f.pelliecus)、辽宁亚种(M.f.dolichocephalus)、长江亚种(M.f.calamorum)和福建亚种(M.f.fujianensis)(华南),作过一般生物学描述[1],对于东方田鼠研究得较多的是长江亚种,60年代有人对该种动物的生态学特点进行了报道,近期对洞庭湖区东方田鼠的种群动态、繁殖特性、迁移行为也有系列研究[2],特别是该种动物具有对日本血吸虫天然抗感染性,引起了学术界的广泛兴趣,本研究通过对人工繁殖的东方田鼠的细胞遗传学的观察,了解该种动物的染色体数目的范围、染色体核型以及染色体G带特征.

简介：Microarrayhasbecomeapopularbiotechnologyinbiologicalandmedicalresearch.However,systematicandstochasticvariabilitiesinmicroarraydataareexpectedandunavoidable,resultingintheproblemthattherawmeasurementshaveinherent"noise"withinmicroarrayexperiments.Currently,logarithmicratiosareusuallyanalyzedbyvariousclusteringmethodsdirectly,whichmayintroducebiasinterpretationinidentifyinggroupsofgenesorsamples.Inthispaper,astatisticalmethodbasedonmixedmodelapproacheswasproposedformicroarraydataclusteranalysis.TheunderlyingrationaleofthismethodistopartitiontheobservedtotalgeneexpressionlevelintovariousvariationscausedbydifferentfactorsusinganANOVAmodel,andtopredictthedifferentialeffectsofGV(genebyvariety)interactionusingtheadjustedunbiasedprediction(AUP)method.ThepredictedGVinteractioneffectscanthenbeusedastheinputsofclusteranalysis.Weillustratedtheapplicationofourmethodwithageneexpressiondatasetandelucidatedtheutilityofourapproachusinganexternalvalidation.

简介：Annotationsofcompletegenomesequencessubmitteddirectlyfromsequencingprojectsarediverseintermsofannotationstrategiesandupdatefrequencies.Theseinconsistenciesmakecomparativestudiesdifficult.Toallowrapiddataprepara-tionofalargenumberofcompletegenomes,automationandspeedareimpor-tantforgenomere-annotation.Hereweintroduceanopen-sourcerapidgenomere-annotationsoftwaresystem,Restauro-G,specializedforbacterialgenomes.Restauro-Gre-annotatesagenomebysimilaritysearchesutilizingtheBLAST-LikeAlignmentTool,referringtoproteindatabasessuchasUniProtKB,NCBInr,NCBICOGs,Pfam,andPSORTb.Re-annotationbyRestauro-Gachievedover98%accuracyformostbacterialchromosomesincomparisonwiththeoriginalmanuallycuratedannotationofEMBLreleases.Restauro-GwasdevelopedinthegenericbioinformaticsworkbenchG-languageGenomeAnalysisEnvironmentandisdistributedathttp://restauro-g.iab.keio.ac.jp/undertheGNUGeneralPublicLicense.

简介：

简介：~~

简介：<正>Asoneofthemostcharacterizedcytokines,interleukin3(IL-3)iswellknownforitssurvivaleffectonbothprogenitorsandmaturebloodcells.Althoughwiththeextensivestudies,thesignalingpathwaysandunderlyingmechanismleadingtosurvivalresponsesofIL-3stillarenotcompletelyunderstood.Recently,anapoptoticgeneticpathwayofC.eleganswassuggestedtobeevolutionallyconservedinthatcontrolsthecytokine-dependentanti-apoptoticresponsesinmammalianhematopoieticcelllineages.Amongthispathway,Ces-2isknowntobethefirstdeathspecificationgeneintheC.eleganspathwayandencodesabZIPfamilytranscriptionalfactorthatsharesthesameDNArecognitionsequencewithanoncoprotein,

简介：hPFTAIRE1(PFTK1)，Cdc2相关的蛋白质kinase，高度在人的大脑被表示。它在Hela房间展出细胞质的分发，尽管它在它的N终点包含二个原子本地化信号(NLS)。到为它的底层和规章的部件的搜索，我们由把全身的hPFTAIRE1用作一个诱饵屏蔽了一个二混血儿的图书馆。四14-3-3isoforms(贝它，epsilon，希腊语字母的第七字，字形物)被识别与hPFTAIRE1交往。我们在hPFTAIRE1发现了一个通常认为的14-3-3绑定一致主题(RHSSPSS)，它与它的第二NLS重叠了。RHSSPSS主题的删除或有在保存有约束力的主题的翼的Ser119的替换废除了在hPFTAIRE1和14-3-3蛋白质之间的特定的相互作用。变异的S120AhPFTAIRE1也显示出一个弱相互作用到14-3-3蛋白质。结果建议Ser119为在hPFTAIRE1和14-3-3蛋白质之间的相互作用是关键的。当熔化了到绿荧光灯的蛋白质(GFP)的C终点时，所有hPFTAIRE1异种在Hela房间和人的neuroblastoma房间(SH-SY5Y)的细胞质散布了，显示有14-3-3蛋白质的那绑定不贡献潜水艇hPFTAIRE1的细胞的本地化，尽管绑定可以涉及它的发信号的规定。

简介：Glucosetransporter4(GLUT4)isresponsibleforinsulin-stimulatedglucosetransportingintotheinsulin-sensitivefatandmusclecells.ThedynamicsofGLUT4storagevesicles(GSVs)remainstobeexploredanditisunclearhowGSVsarearrangedbasedontheirmobility.Weexaminedthisissuein3T3-L1cellsviainvestigatingthethree-dimensionalmobilityofsingleGSVlabeledwithEGFP-fusedGLUT4.Athinlayerofcytosolrightadjacenttotheplasmamembranewasilluminatedandsuccessivelyimagedat5Hzunderatotalinternalreflectionfluorescencemicroscopewithapenetrationdepthof136nm.Employingsingleparticletracking,thethree-dimensionalsubpixeldisplacementofsingleGSVwastrackedataspatialprecisionof22nm.Boththemeansquaredisplacementandthediffusioncoefficientwerecalculatedforeachvesicle.Trackingresultsrevealedthatvesiclesmovedasifrestrictedwithinacagethathasameanradiusof160nm,suggestingthepresenceofsomeintracellulartetheringmatrix.ByconstructingthehistogramofthediffusioncoefficientsofGSVs,weobservedasmoothdistributioninsteadoftheexistenceofdistinctgroups.TheresultindicatesthatGSVsaredynamicallyretainedinacontinuousandwiderangeofmobilityratherthanintoseparateclasses.

简介：CT120,anovelmembrane-associatedgeneimplicatedinlungcarcinogenesis,waspreviouslyidentifiedfromchromosome17pl3.3locus,ahotmutationspotinvolvedinhumanmalignancies.Inthepresentstudy,wefurtherdeterminedthatCT120ectopicexpressioncouldpromotecellproliferationactivityofNIH3T3cellsusingMTSassay,andmonitoredthedownstreameffectsofCT120inNIH3T3cellswithAtlasmousecDNAexpressionarrays.Among588knowngenes,133geneswerefoundtobeupregulatedordownregulatedbyCT120.Twomajorsignalingpathwaysinvolvedincellproliferation,cellsurvivalandanti-apoptosiswereoverexpressedandactivatedinresponsetoCT120:OneistheRaf/MEK/ErksignalcascadesandtheotheristhePI3K/Aktsignalcascades,suggestingthatCT120mightcontribute,atleastinpart,totheconstitutivelyactivationofErkandAktinhumanlungcanercells.Inaddition,sometumormetastasisassociatedgenescathepsinB,cathepsinD,cathepsinL,MMP-2/TIMP-2werealsoupregulatedbyCT120,uponwhichCT120mightbeinvolvedintumorinvasivenessandmetastasis.Inaddition,CT120mightplayanimportantroleintumorprogressionthroughmodulatingtheexpressionofsomecandidate“LungTumorProgression”genesincludingB-Raf,Rab-2,BAX,BAG-1,YB-1,andCdc42.

简介：比较HitrapG蛋白Sepharose亲和色谱系统对不同动物血清或腹水的纯化效果,为抗体纯化提供依据。结果显示,G蛋白对不同动物血清IgG吸附能力不同,体现在单位体积抗体回收量明显不同,这一特点与A蛋白亲和色谱系统相似。该方法简便快速,纯化抗体纯度高,免疫活性好,色谱柱可反复使用多次

简介：heterotrimericguanine核苷酸绑定蛋白质(G蛋白质)被表明了各种各样的发信号调停在植物的小径。然而，它在发信号的phytochromeA(phyA)的角色留下逃犯。在这研究，我们发现新调停phyA的显型指明了far-red照耀(FR)preconditioned房间死亡，它仅仅在跟随暴露到白光(WL)的FR-grown幼苗的胚轴发生。房间死亡在G变异的gpa1被减轻，但是与野类型(WT)比较在G变异的agb1加重了，在调停phyA的房间死亡小径的GPA1和AGB1的对抗角色的陈述语气。进一步的调查显示nonphotoconvertibleprotochlorophyllide(Pchlide633)的导致FR的累积，在暴露上产生反应的氧种类(ROS)到WL，为前提FR的房间死亡被要求。而且，ROS主要在叶绿体被检测用荧光灯探查。有趣地，到黑暗成年的幼苗的H2O2的申请导致类似于前提FR的房间死亡的显型。这表明ROS是为房间死亡的一个批评调停人。另外，我们观察到agb1比WT幼苗对H2O2更敏感，显示G蛋白质可以也修改到ROS应力的幼苗的敏感。一起拿这些结果，我们推断G蛋白质可以涉及表明小径调整Arabidopsis胚轴的前提FR的房间死亡的phyA。在phyA位于G蛋白质的参与下面发信号的可能的机制在这研究被讨论。

简介：Thestudyofsmalldrugmoleculesinteractingwithnucleicacidsisanareaofintenseresearchthathasparticularrelevanceinourunderstandingofrelativemechanisminchemotherapeuticapplicationsandtheassociationbetweengenetics(includingsequencevariation)anddrugresponse.Inthiscontribution,wedemonstratehowthesequence-specificbindingofananticancerdrugDacarbazine(DTIC)tosinglebase(A-G)mismatchcouldbesensitivelydetectedbycombiningelectrochemicaldetectionwithbiosensingsurfacebasedongoldnanoparticles.