简介：分层序列法是一种多目标决策方法，本文将其用于山西省管涔山森林经营局千秋沟林场落叶松经营类型的森林收获调整．结果表明：使用该法，决策者可将对不同目标的要求落实到合理的水平上；该法求解简单，是进行森林收获调整有力的数学工具

简介：本研究以双单倍体马铃薯DM的突变体为材料,利用PCR-walking的方法扩增其突变体的侧翼序列。在试验中,以60个鉴定过的阳性突变体样品为材料扩增后,有28个样品扩增出有效条带。PCR胶回收后测序,有2个样品测序无信号,其他26个样品,将测序与载体序列和马铃薯基因组序列用BLASTN比对,发现有6个样品分别插入到了马铃薯1、3或7号染色体上。通过进一步比对,发现编号为TDM90的突变体中,载体插入了PREDICTED:Solanumtuberosumtrans-resveratroldi-O-methyltransferase-like(LOC102590422),mRNA马铃薯反式白藜芦醇基因中。试验说明了PCR-walking法扩增马铃薯侧翼序列是可行的。且载体插入马铃薯反式白藜芦醇基因中对马铃薯白藜芦醇基因的表达有何影响,有进一步研究下去的重要意义。

简介：家蚕由野桑蚕驯化而来，而野桑蚕sericin1及其上游调控序列的相关研究较少。本研究以家蚕sericin1及其上游调控序列设计引物克隆野桑蚕sericin1及其上游调控序列，将克隆得到的野桑蚕Sericin1序列翻译后用muscle软件与家蚕Sericin1蛋白序列比对，结果表明预测的野桑蚕Sericin1氨基酸序列与家蚕Sericin1A’（Ser1A’）氨基酸序列相似性很高，达98％。野桑蚕丝胶1基因上游调控序列与家蚕一样也存在多态性，克隆得到了106Ibp和636bp的两条序列，中间存在425bp的插入序列，与家蚕丝胶1基因上游调控序列相似性分别为98％和97％。

简介：鉴于泛素与植物受高温等环境胁迫下产生的一些诱导型蛋白降解有关,本研究根据擎天凤梨Ostara早期花器的全长cDNA文库,经大规模随机测序及重叠群（contigs）内EST序列的拼接,获得了擎天凤梨多聚泛素基因全长cDNA序列（GenBank登录号：GQ890686）,序列长1896bp,开放阅读框长1323bp,编码441个蛋白氨基酸残基,蛋白质分子质量为49.3kD,等电点pI为6.59。蛋白二级结构预测显示,该蛋白主要由随机卷曲、延伸链、α螺旋和β-转角组成;系统进化树分析表明与拟南芥推定的多聚泛素UBQ10（gi｜23397122｜gb｜AAN31845.1｜）亲缘关系最近;经推断它是由5个单体泛素组成的多聚泛素。本研究有助于进一步探讨该基因在低温胁迫下的反应机理以及如何采用分子调控手段增强擎天凤梨的耐低温能力。

简介：本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明：在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明：相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征。

简介：在天坛圜丘坛完整的前提下,从进入圜丘坛门开始,到祭天活动结束,主祭者和参与者们都经历过一个空间序列,产生过相应的联想。正是这个空间序列与产生过的相应联想,使天坛的圜丘坛在中国古人视野中更具有神秘的氛围,也给后人留下了古人宇宙观状况和巧妙营造空间氛围的信息载体。说其是一笔财富,也不为夸张。清乾隆皇帝冬至圜丘祀天,入圜丘坛门,经牺牲所西侧路与牺牲所南门前路,到南外坛西石牌楼。这是第一个拐尺形的空间。这一空间,始有圜丘坛门,沿途槐树夹道,树外右侧有外坛墙,左侧有牺牲所院墙,前有石牌楼。

简介：分别以雷竹嫩叶的基因组DNA和幼穗的cDNA为模板，采用PCR方法扩增出长为490bp及262bp的片段。序列分析结果表明，该基因序列包含1个长为228bp的内含子。其编码区共编Ns86个氨基酸。其氨基酸序列与水稻中OsFCA、小麦中TaFCA的一致性分别为79．8％与69．9％，表明雷伢中可能存在调控开花的自主调控途径。

简介：对景观空间序列与交响乐曲式进行相关性对比探讨,发现二者具有视觉与听觉的时空通感和理性与感性的精神共鸣,借鉴音乐表情提出利用景观表情带动景观意境组织;以哈尔滨道外公园为应用案例进行景观主题与景观空间序列的规划设计,融合西方交响乐曲式结构的同时,沿用了传统隐喻抒怀的创作思路,在现代景观中体现了我国古典园林的包容性和不定性,以期为构思具有逻辑性和系统性的景观空间序列提供相关指导和建议。

简介：由于广西一些养殖场频繁发生以母猪流产、死胎、木乃伊、仔猪呼吸道症状等为特征的流行性传染病，怀疑为猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）感染所致．广西大学动物科学技术学院黄伟坚等从病猪中采集材料，经RT—PCR检测为硝、性后，接种于Marc-145细胞，经过六代盲传，发现典型的细胞病理变化（CPE），经鉴定为PRRSV，命名为GXA株，其毒价为105．33TCID50／mL．参考VR-2332和CH-la株基因序列，设计了3对特异性引物。分别对GXA株的E、M、N基因同时进行了RT—PCR扩增、克隆和测序．应用DNAstar生物学软件拼接得到GX丸株的E，M和N3个基因片段共长为1473bp．同源性分析表明。GXA株与VR-233、MLV和RJ-4的同源性为99.7％-100％，而与欧洲型代袭株LV的同源性只有66．4％．表明GXA与VR-233、MLV和RJ-4株亲缘关系比较密切；与欧洲代表株LV亲缘关系较最远。属于美洲型毒株，有可能来源于疫苗株．

简介：在此,我们报道一个黄龙病菌亚洲种（‘CandidatusLiberibacterasiaticus’）（广西-1菌株）的全基因组序列。该菌株基因组由1个环状染色体构成,大小为1,268,237bp,G＋C含量为36.5%,包含1,141个开放阅读框,44个tRNA,3个完整的rRNA。

简介：MADS-box基因是一类编码转录因子的基因大家族,在植物的发育过程中具有重要作用。本研究采用RT-PCR技术从叶籽银杏（Ginkgobilobavar.epiphyllaMak.）中克隆了MADS-box基因GbMADS5。序列分析表明,该基因编码区全长为666bp,含有一个完整的开放阅读框,编码221个氨基酸残基组成的蛋白质,具有典型的植物MADS-box基因结构,编码肽链包含了MADS区、I区、K区和C末端,但该基因不具有拟南芥（Arabidopsisthaliana）AG基因的N端区域。GbMADS5基因编码的蛋白序列与其它植物的MADS-box蛋白序列有着较高的一致性,与裸子植物（Gymnospermae）的AG基因相似性最高,其中与苏铁（Cycasrevolute）的同源性高达91.07%。系统发育树分析显示,GbMADS5基因属于AG亚家族基因。

简介：为研究黄金茶出芽早的分子机制，本研究采用SMART-RACE技术，获得了与解除休眠相关的转录因子CsDAM2基因的全长eDNA序列，并进一步对该氨基酸序列进行了生物信息学分析。研究发现CsDAM2基因全长为1386bp，序列分析表明，该序列含有一个完整的编码区，大小为657bp，编码区GC含量为50．45％。此编码区可以编码分子量为24．86kD的亲水性蛋白，该蛋白由218个氨基酸组成，理论等电点（pI）为8．96。黄金茶CsDAM2蛋白有11个磷酸化位点，属跨膜蛋白，与毛白杨DAM3的相似性为71％，与已登录茶树MADS．box蛋白的一致性为35％。本研究为进一步揭示黄金茶春芽萌发早的分子机制提供了理论依据。

简介：参考GenBank上发表的猪星状病毒亚基因组序列,设计1对引物,对猪星状病毒广西流行株衣壳蛋白ORF2基因进行扩增,最终克隆得到PAstV/NNJG7株的衣壳蛋白完整序列。序列分析发现,其ORF2全长2358bp,编码786个氨基酸;与猪星状病毒Ⅰ型参考株核苷酸同源性最高,为77.3%-79.4%;在ORF1b和ORF2连接处有一段高度保守的序列,在ORF23′端有一段长83bp非翻译序列及一个含43bp高度保守的茎环样基序。

简介：对废弃4年、9年和14年的3块废弃农田的木本植物物种组成、植物密度和种群结构的恢复情况进行了表征。在每块废弃地上,建立70个100m2样地,鉴别和计数幼苗、幼树和成年树。在4年龄林分中有13科17物种,9年龄林分中有29科48物种,14年龄林分中有22科44物种。在不同的演替阶段,林分中优势种不同。Lonchocarpusacuminatus在4年龄林分中重要值最高,Myrospermunfrutescens,榆梧桐和破布木在9年龄林分中重要值最高;Caesaeriacorymbosa,南美假樱桃、墨西哥丁香和红花风铃木在14年龄林分中重要值最高。从4年龄到14年龄的废弃地,总的立木度从5011株/hm2增加到9631株/hm2。胸径在1cm以上的植株总的基面积也随废弃农田年龄增加而增加。总的来讲,小的植株(胸径小于10cm)的基面积超过总的基面积的一半。9年龄林分物种丰富度最高,14年龄和4年龄林分次之。总之,相比于林分结构属性,次生林植物种类构成可以快速恢复到成熟林水平,这与热带干早森林总的演替趋势是相一致的。

简介：本研究对甜瓜黄瓜素基因启动子进行了元件分析。讨论以采集的甜瓜叶片为试验材料,采用CTAB法提取植物DNA,并利用PCR扩增技术,成功获得了黄瓜素启动子的基因序列,利用DNAman、DNAstar等软件进行处理和分析序列结果,并采用PlantCARE和PLACE对启动子的元件进行生物信息学元件分析。分析结果表明:黄瓜素启动子与AY055805、LN713264、LN681897的同源性为100%、99%、99%。其序列含有多种高等植物果实启动子通用的顺式作用元件TATA-Box、CAAT-Box和光响应元件,同时部分序列还也参与了ABA、VP1反应和水杨酸反应。甜瓜黄瓜素启动子的研究为下一步利用该启动子进行深入的果实基因工程研究提供材料基础和理论依据。

简介：为了探明烟草脉带花叶病毒危害和流行的机制,使用RT-PCR技术扩增获得TVBMV云南分离物YN9.1基因组全序列,并进行了基因组结构、序列同源性、氨基酸保守基序、系统进化和重组分析。结果表明：（1）YN9.1基因组具有Potyvirus属病毒典型特征,含有在Potyvirus属病毒中较为少见的NIb/CP切割位点Q/N;（2）YN9.1与其它分离物核苷酸序列同源性为90.5-91.1%,氨基酸序列同源性为95.2-96.2%。与YND核苷酸和氨基酸序列同源性最高;（3）对HC-Pro和CP保守基序进行了分析。YN9.1具有RITC、PTK、DAG等病毒蚜虫传播保守基序,其中RITC在Potyvirus属病毒中常见形式为KITC;（4）系统进化树分析结果显示,TVBMV进化形成2个组,云南分离物独立进化形成一组,TVBMV进化与地域具有明显的相关性;（5）重组分析发现PY为ZC1和YN的组内重组体,重组位点位于HC-Pro3’末端和NIb5’端。

简介：目前，在铁皮石斛多糖的研究主要集中在多糖的结构、生物活性等方面，对多糖合成相关基因研究较少，本研究通过对‘红鑫1号’铁皮石斛幼苗期和二年生植株以及‘红鑫6号’铁皮石斛二年生植株叶、茎、根三部位蔗糖合成酶基因进行RT-PCR扩增与测序，发现‘红鑫1号’与‘红鑫6号’铁皮石斛的蔗糖合成酶前体mRNA存在拼接差异的现象，主要形成三种不同的mRNA转录本，其翻译得到的蔗糖合成酶，结构功能没有改变；分析序列的可变剪切的差异；同时对铁皮石斛叶、茎、根嬲的表达量进行半定量RT-PCR检测，蔗糖合成酶基因在植株中不同部位表达量不同，其表达模式表现为茎〉叶〉根。本研究为铁皮石斛蔗糖合成酶基因功能研究提供了科学依据。

简介：测定了盘桑2号、固桑2号、固桑lO号、圃桑14号、固桑6号、圃桑11号、圃桑12号等7个特殊桑树品种资源的ITS序列，长度均为576bp，A＋T％=40．45[233]，c＋G％=59．55[343]，其中114a，176c，167g，119t，无变异位点。最大简略法（MaximumParsimonyMethod，MP）分析亲缘关系，均分在一个分支，亲缘关系差异不大。用分子方法分析桑树品种的亲缘关系时，可先用ITS分析品种的大致的亲缘关系范围，再用RAPD、AFLP、SSR、ISSR等方法进行细分。

简介：收集60个杉木人工林样地的直径序列分布,用4种方程式拟合直径序列(y)和株号序列(x)之间的相关关系,结果表明:指数函数和线性函数相关性最显著,对数函数和幂函数的相关性次之,且当P=0.01时,相关系数值均大于0.95,无论自由度大小,均达到极显著水平。并举例说明杉木人工林直径序列的这种线性及非线性分布,在确定抚育间伐的间伐木最大胸径与间伐蓄积量时的应用。

简介：本研究通过卷丹百合在不同浓度的盐胁迫下确定了盐浓度阈值,利用同源克隆和RACE技术获得了盐阈值浓度处理下卷丹百合MAPK基因的保守区(Genbank登录号:JQ437268),并对其进行生物信息学分析。同时利用了DNAman软件和Blastn序列比对在基因和蛋白角度分析了MAPK基因在盐阈值浓度处理下的表达情况。分析表明,卷丹百合盐阈值浓度为1.09mg/mL,MAPK基因保守区长627bp,推测编码209个氨基酸,有1个高度保守的区域(TRWYRAPE)存在于MAPK氨基酸序列中,通过NCBI上的BLAST比对分析,发现这段保守区序列为促分裂原活化蛋白激酶超家族的催化活性区。