简介：摘要二代测序（NGS）作为一种以高通量、高灵敏度为特点的新型测序技术，在儿童血液系统疾病中的应用较为普及。为进一步协助临床医生在儿童血液病诊疗中合理应用NGS检测并正确解读结果，中国抗癌协会小儿肿瘤专业委员会、中华医学会儿科学分会血液学组针对目前儿童血液系统疾病中常用的NGS技术，结合国内外研究进展、行业规范以及相关指南，共同撰写了此共识。

简介：【摘要】目的：本研究旨在探讨宏基因组二代测序（mNGS）在预测院内感染方面的应用价值，并与常规微生物学检测（CMT）进行比较。方法：我们回顾性分析了2022年1月至2022年12月在我院收治的75例疑似院内感染患者。所有样本都同时进行了CMT和mNGS检测。结果：通过CMT确诊感染的有30例（40%），而通过mNGS确诊的有45例（60%）。统计分析显示，mNGS在诊断准确性（P=0.01）、报告时间（P=0.004）、病原体种类检出（P=0.003）以及混合感染检出率（P=0.01）方面均显著优于CMT。结论：mNGS在院内感染的预测和诊断方面具有高度的应用价值，表现出对多种病原体以及混合感染的高灵敏度和准确度，且能在更短的时间内给出结果。

简介：摘要病原体宏基因组高通量测序(mNGS)技术为疑难危重症及罕见病原体感染的诊断提供了有效的技术手段。为更好的在重症肺部感染病原诊断领域应用这一技术，基于已发布的专家共识，本文从肺部感染病原诊断思维、mNGS送检适应证、如何提高送检标本质量、重症肺部炎症性疾病mNGS结果解读策略等方面做出述评。

简介：摘要目的分析宏基因组二代测序（metagenomic next-generation sequencing，mNGS）技术在脑脓肿病原菌检测中的应用价值。方法回顾性分析天津市环湖医院2019年1月至2021年12月年脑脓肿患者资料，所有患者均行立体定向下脓肿穿刺引流。根据病原菌检测方法不同，分为细菌培养组（仅行细菌培养）与mNGS组（行mNGS同时行细菌培养）。比较两组患者的临床症状、脓肿部位、细菌培养和mNGS结果，抗生素应用方案及预后，对两组患者细菌检测结果进行分析，并对患者抗生素应用情况及预后进行比较。采用X2检验或精确概率法及Mann-Whitney U检验，比较两组差异有无统计学意义。结果共纳入脑脓肿患者43例，其中细菌培养组21例，mNGS组22例。细菌培养组细菌阳性率42.9%（9/21），mNGS组细菌培养阳性率45.5%（10/22）。mNGS检测阳性率100%（22/22），细菌培养组仅3例有较明确的细菌来源，mNGS组根据细菌结果17例明确细菌来源，两组差异有统计学意义（χ2=19.69，P<0.001）。细菌培养回报时间为7.0（4.0，7.0）d，mNGS回报时间为1.5（1.5，1.5）d，两组细菌回报时间差异有统计学意义（Z=0.00，P<0.001），细菌培养组抗生素使用费用为2.40（0.56，3.10）万元，mNGS组抗生素使用费用为1.20（0.21，2.00）万元，两者差异有统计学意义（Z=5.22，P=0.026）。结论mNGS能够快速准确地明确脑脓肿病原菌种类及来源，指导临床更有针对性地应用抗生素，降低抗生素使用费用，是脑脓肿病原菌检测的有效手段。

简介：摘要目的探讨肺泡灌洗液(BALF)宏基因二代测序技术(mNGS)在诊断肿瘤重症患者重症肺炎(SP)中的临床应用价值。方法选取2020年7月至2022年8月期间江苏省肿瘤医院重症监护室42例SP患者，所有患者均进行BALF-mNGS检测和病原微生物培养，回顾性分析其临床特点、实验室检查、影像学检查及诊治过程，评价BALF-mNGS在诊断肿瘤重症患者SP的临床应用价值。结果42例患者中，传统病原微生物培养阳性24例(57.14%)，其中混合感染6例(14.29%)，共检出31株病原菌；BALF-mNGS检测阳性36例(85.71%)，其中混合感染29例(69.05%)，共检出148株病原菌；BALF-mNGS检测的阳性率与2种及以上病原菌感染检出率均高于传统病原微生物培养[85.71%(36/42)比57.14%(24/42)，χ2＝8.400，P<0.05；69.05%(29/42)比14.29%(6/42)，χ2＝25.910，P<0.05]。以传统培养为"金标准"，BALF-mNGS检测的敏感度、特异度、阳性预测值及阴性预测值，结果分别为95.8%、27.8%、63.9%、83.3%。单因素分析显示，未见BALF-mNGS对病原菌检出率的影响因素存在(P>0.05)。结论在肿瘤重症患者SP中，BALF-mNGS对病原菌检出率高于传统培养方法，且干扰因素少，有助于指导肿瘤重症患者SP的诊断和治疗。

简介：摘要目的探讨宏基因二代测序（metagenomic next-generation sequencing，mNGS）在腹膜透析（peritoneal dialysis，PD）相关腹膜炎病原学诊断中的价值。方法该研究为回顾性队列研究。分析2020年6月至2021年7月在南京大学医学院附属鼓楼医院就诊并同时留取PD流出液样本行病原体mNGS检测和微生物培养的PD相关腹膜炎患者的临床资料，比较mNGS检测和传统微生物培养对PD相关腹膜炎病原学诊断的阳性率、时效性和一致性。结果共18例PD相关腹膜炎患者纳入本研究，其中男性11例，女性7例，年龄（50.4±15.4）岁，中位透析龄34.0（12.4，62.0）个月。mNGS检测共有17例患者检出致病菌，阳性率为17/18，高于微生物培养的13/18，但差异无统计学意义（P=0.219）。两种检测方法均阳性的患者有12例，其中11例患者检出的致病菌一致；5例微生物培养阴性患者的mNGS检测为阳性，包括表皮葡萄球菌3例（1例同时检出表皮葡萄球菌和人葡萄球菌）、结核分枝杆菌1例及解脲脲原体1例；1例患者微生物培养阳性（大肠埃希菌）而mNGS检测阴性。mNGS检测报告时间显著低于微生物培养［25.0（24.0，27.0）h比89.0（72.8，122.0）h，Z=3.726，P < 0.001］。结论mNGS对PD相关腹膜炎的病原体检测敏感性高，检出致病菌与微生物培养具有较好的一致性，并缩短了检出时间，可能成为PD相关腹膜炎特别是难治性腹膜炎病原体识别的新途径。

简介：摘要目的分析新型冠状病毒Delta变异株引起的家庭二代续发率（HSAR）及影响因素。方法2021年7月南京市报告一起Delta变异株引起的聚集性疫情，累计报告现住址为南京市的病例235例，分布于171个家庭，筛选出存在家庭密接接触者（家庭密接）的家庭及家庭密接作为研究对象，收集家庭首发病例和家庭密接相关信息，采用多因素logistic回归模型分析家庭HSAR及影响因素。结果103个家庭共报告家庭密接234名、家庭续发病例64例，HSAR为27.4%（95%CI：22.0%~33.4%），家庭规模2~3、4~5、6~9人的家庭分别占64.1%（66个）、26.2%（27个）、9.7%（10个）；共报告家庭聚集性疫情35起，占34.0%（35/103）。103例家庭首发病例中，男性占27.2%（28例），年龄M（Q1，Q3）为49（9，56）岁；234名家庭密接中，男性占59.0%（138例）；年龄M（Q1，Q3）为42（20，55）岁；暴露时间M（Q1，Q3）为3（1，3）d。多因素logistic回归模型分析结果显示，家庭首发病例为机场工作人员（OR=2.913，95%CI：1.469~5.774）、发现途径为居家隔离筛查（OR=6.795，95%CI：1.761~26.219）和社会面筛查（OR=4.239，95%CI：1.098~16.368）的家庭内HSAR风险更高；家庭密接暴露时长越长（OR=1.221，95%CI：1.040~1.432）、未接种疫苗（OR=2.963，95%CI：1.288~6.813）和未全程接种疫苗（OR=2.842，95%CI：0.925~8.731）的家庭内HSAR风险更高。结论Delta变异株代间距缩短，家庭内传播能力较强；家庭首发病例是否为机场工作人员、发现途径，以及家庭密接疫苗接种、暴露时长是家庭HSAR的影响因素。

简介：【摘要】目的：研究宏基因组二代测序技术对肺部感染病原菌检测的临床意义。方法：选取肺部感染的患者，选取时间为2020年1月-2021年1(9)月没那么多，选取例数为64例。所有患者均接受宏基因组二代测序技术（mNGS）检测，收集患者临床资料、mNGS检测结果、传统病原学检测结果。比较患者mNGS检测结果和传统病原学检测结果阳性率情况和临床诊断一致性情况，同时探讨抗菌药物治疗中mNGS的指导性作用。结果：所选64例患者中，38例为支气管肺泡灌洗液标本、16例为痰标本、10例为血液标本。mNGS检出病原菌包括16例结核分枝杆菌、1鸟分枝杆菌、12例鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯、1铜绿假单胞菌、1、肺炎链球菌、诺卡菌、10例曲霉菌、7例肺孢子菌、3例病毒、6例念珠菌。mNGS检测结果阳性率为93.75%、临床符合率为71.88%，分别高于传统病原学检测的21.88%、6.25%，均有显著差异，P＜0.05。根据mNGS检测结果，为40例患者提供抗菌药物治疗调整方案，调整后临床症状显著改善的患者有28例，有效率为70.00%。结论：在肺部感染患者的病原菌检测当中，采用宏基因组二代测序技术，能够使病原菌检出率大大提升，同时可提高与临床结果的符合率，为抗菌药物治疗方案的制定和调整提供方案，具有重要的临床价值。

简介：摘要：弓形虫脑炎（ＴＥ）是艾滋病（ＡＩＤＳ）患者 最 常见的神经系统机会性感染之一，病死率高，临床表现无特异性，确诊的金标准为脑活检，该操作有一定风险，临床实用性较低。本研究旨在探索脑脊液宏基因组二代测序在艾滋病患者合并弓形虫脑炎诊断中的应用。本文分析 1例艾滋病（AIDS）合并弓形虫脑炎患者临床表现及诊疗经过，后结合脑脊液mNGS技术早期诊断及成功抗感染治疗后好转出院。该病例提示在免疫缺陷合并中枢神经系统感染的患者中，应用mNGS辅助早期诊断提供了一种新的方法。

简介：摘要目的探讨宏基因组测序（mNGS）在艾滋病合并耶氏肺孢子菌感染患者中的诊断价值。方法回顾性研究。收集2019年1月至2021年6月长沙市第一医院艾滋病科诊断为艾滋病合并感染共236例患者的呼吸道和其他体液标本及其病例背景资料，同时进行传统病原学六胺银染色、血清G试验和mNGS检测。采用Fisher精确检验统计分析其结果，比较mNGS与六胺银染色和血清G试验的诊断性能差异。结果共收集艾滋病合并肺部感染的患者236例，临床初步诊断耶氏肺孢子菌肺炎患者77例，非耶氏肺孢子菌肺炎患者159例。艾滋病合并肺部感染患者中，mNGS检测出耶氏肺孢子菌阳性者77例，检出率为32.63%（77/236），六胺银染色法检测，耶氏肺孢子菌阳性者10例，检出率为4.24%（10/236），血清G试验阳性者146例，检出率为61.86%（146/236）。以临床治疗性诊断为标准，77例耶氏肺孢子菌肺炎患者中，mNGS检测的敏感度为100%（77/77），高于六胺银染色［12.99%（10/77），P=0.046］和血清G试验［58.44%（45/77），P=0.038］。mNGS检测具有良好的特异度，与六胺银染色的特异度相同，均为100%（159/159），高于血清G试验［36.48%（58/159），P=0.026］。以治疗性临床诊断为参考方法，mNGS检测的符合率为100%（236/236）。结论mNGS检测对艾滋患者合并耶氏肺孢子菌感染诊断的敏感度和特异度高，对耶氏肺孢子菌感染有较好的诊断价值。

简介：【摘要】目的：研究宏基因组二代测序技术和真菌半乳甘露聚糖测定（GM试验）对诊断马尔尼菲青霉菌感染（PSM)的价值。方法：以2022年6月-2023年6月我院确诊PSM的患者为研究对象(PSM组)，以同期收治的无合并PSM的肺部真菌感染病例作为对照，各45例，比较2组肺泡灌洗液宏基因组二代测序技术和真菌半乳甘露聚糖测定结果，病原学检查作为金标准，分析其对诊断马尔尼菲青霉菌感染的临床应用价值。结果：宏基因组二代测序技术诊断PSM的灵敏度、特异度、准确性、阴性预测值、阳性预测值均为97.78%，均高于GM试验，差异具有统计学意义（P＜0.05）。结论：宏基因组二代测序技术和GM试验对诊断PSM均具有一定的价值，其中宏基因组二代测序技术价值更高。

简介：

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简介：摘要：目的：采用GC法检测聚乙二醇4000中乙二醇、二甘醇、三甘醇的含量。方法：色谱柱以50%苯基-50%甲基聚硅氧烷的毛细管柱，采用程序升温方式，内标法进行定量。结果：乙二醇、二甘醇、三甘醇的对照品溶液浓度在分别在4μg/ml~80μg/ml与峰面积呈良好线性关系，相关系数r均大于0.9990。乙二醇、二甘醇、三甘醇的重复性试验RSD分别为5.2%、6.9%、7.2%。结论：说明该检测方法专属性强，简便，灵敏度高，可适用于聚乙二醇4000中乙二醇、二甘醇、三甘醇的检测。

简介：

简介：【摘要】随着人口老龄化进程的加快，老年患者在住院治疗中的比例逐年升高。老年患者由于生理、心理等方面的变化，机体免疫功能降低，易患各种疾病，并且在药物治疗中具有一定的特殊性。因此，如何更好地合理应用药物治疗，最大限度地发挥药物在疾病治疗中的作用，已成为临床上需要解决的重要问题。

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