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34 个结果
  • 简介:Thepromoterregionofadroughtandabscisicacid(ABA)induciblegene,osr40c1,wasisolatedfromasalt-tolerantindicaricevarietyPokkali,whichis670bpupstreamoftheputativetranslationstartcodon.Insilicopromoteranalysisofresultedsequenceshowedthatatleast15typesofputativemotifsweredistributedwithinthesequence,includingtwotypesofcommonpromoterelements,TATAandCAATboxes.Additionally,severalputativecis-acingregulatoryelementswhichmaybeinvolvedinregulationofosr40c1expressionunderdifferentconditionswerefoundinthe5′-upstreamregionofosr40c1.TheseareABA-responsiveelement,light-responsiveelements(ATCT-motif,BoxI,G-box,GT1-motif,Gap-boxandSp1),myeloblastosisoncogeneresponseelement(CCAAT-box),auxinresponsiveelement(TGA-element),gibberellin-responsiveelement(GARE-motif)andfungal-elicitorresponsiveelements(BoxEandBox-W1).Aputativeregulatoryelement,requiredforendosperm-specificpatternofgeneexpressiondesignatedasSkn-1motif,wasalsodetectedinthePokkaliosr40c1promoterregion.Inconclusion,thebioinformaticanalysisofosr40c1promoterregionisolatedfromindicaricevarietyPokkaliledtotheidentificationofseveralimportantstress-responsivecisactingregulatoryelements,andtherefore,theisolatedpromotersequencecouldbeemployedinricegenetictransformationtomediateexpressionofabioticstressinducedgenes.

  • 标签: 启动子序列 计算机分析 籼稻品种 分离 顺式调控元件 CAAT盒
  • 简介:以便揭示在二CCDD染色体种,Oryzaalta和Oryzalatifolia之间的起源和进化关系,在situ杂交(鱼)的荧光被采用从O与C0t-1DNA分析二种的染色体。alta作为一根探针。Karyotype比较地也在O之间被分析。alta和O。latifolia基于他们杂交的类似的乐队模式发信号。在O之间有高相同和靠近的关系。alta和O。然而,在杂交之间的区别表明的latifolia也是清楚的。C0t-1DNA被证明是种类--并且染色体类型特定。C0t-1DNA鱼能是更有效的分析在不同种类之间的genomic关系,这被建议。根据在二allotetraploidy种之间的高度并且中等重复的DNA序列的比较分析,O。alta和O。latifolia,可能的起源和Oryza的allotetraploidy的进化机制被讨论。

  • 标签: 重复DNA序列 D基因组 水稻 染色体核型分析 杂交信号 原位杂交
  • 简介:有低glutelin内容的瑞斯作为为肾失败影响的病人的功能的食物合适。在米饭的低glutelin内容基因Lgc1有在二高度类似的glutelin基因GluB4和GluB5之间的3.5-kb删除,它在染色体2的短手臂上定位。在低glutelin内容米饭改进选择效率繁殖,指定为InDel-Lgc1-1和InDel-Lgc1-2的二个分子的标记被开发检测低glutelin内容基因Lgc1。双PCR察觉显示二个标记的联合使用能容易把Lgc1的遗传型与不同米饭变化区分开来。作为一种简单、便宜的技术,因此,分子的标记能广泛地被用来与Lgc1基因识别不同变化并且在低glutelin内容米饭的帮助标记的选择适用。

  • 标签: 蛋白基因 水稻育种 分子标记 蛋白含量 ORYZA PCR检测
  • 简介:在米饭restorer线C224的条纹疾病抵抗的继承为量的特点加多基因用主要基因的混合效果模型被分析。另外,抵抗与维护者线在C224的七个十字被调查。结果证明C224的条纹抵抗被二主要基因与添加剂优势效果(E-1模型)加多基因与additive-dominance-epistasis效果控制。这二基因有12.47%和24.75%分别地,出现的否定优势效果的添加剂效果。在二主要基因之间有重要epistasis和相互作用效果。当多基因的是2.74%时,二主要基因的可遗传性是92.12%,显示条纹抵抗有主导的主要基因效果。七个十字,五显示了高或中等的抵抗到条纹疾病。

  • 标签: 主基因+多基因 混合效应模型 条纹叶枯病 水稻恢复系 遗传分析 上位性效应
  • 简介:Rice(Oryzasativa)issensitivetosalinity,butthesalttoleranceleveldiffersamongcultivars,whichmightresultfromnaturalvariationsinthegenesthatareresponsibleforsalttolerance.High-affinitypotassiumtransporter(HKTs)hasbeenproventobeinvolvedinsalttoleranceinplants.Therefore,wescreenedfornaturalnucleotidepolymorphisminthecodingsequenceofOsHKT1,whichencodestheHKTproteinineightVietnamesericecultivarsdifferinginsalttolerancelevel.Intotal,sevennucleotidesubstitutionsincodingsequenceofOsHKT1werefound,includingtwonon-synonymousandfivesynonymoussubstitutions.Furtheranalysisrevealedthatthesetwonon-synonymousnucleotidesubstitutions(G50TandT1209A)causedchangesinaminoacids(Gly17ValandAsp403Glu)atsignalpeptideandtheloopofthesixthtransmembranedomain,respectively.Toassessthepotentialeffectofthesesubstitutionsontheproteinfunction,the3DstructureofHKTproteinvariantswasmodelledbyusingPHYRE2webserver.Theresultsshowedthatnodifferencewasobservedwhencomparedthosepredicted3DstructureofHKTproteinvariantswitheachother.Inaddition,thecodonbiasofsynonymoussubstitutionscannotclearlyshowcorrelationwithsalttolerancelevel.Itmightbeinterestingtofurtherinvestigatethefunctionalrolesofdetectednon-synonymoussubstitutionsasitmightcorrelatetosalttoleranceinrice.

  • 标签: 水稻科学 农业
  • 简介:ThecompleteopenreadingframeofOsPIN1awasamplifiedthroughreversetranscriptase-polymerasechainreaction(RT-PCR)basedonthesequencedepositedinGenBanktoexploretherelationshipbetweentheauxineffluxproteinOsPIN1aandthenegativephototropismofriceroots.SequencingresultsshowedthattheGCcontentofOsPIN1awas65.49%.ThefusionexpressionvectorpCAMBIA-1301-OsPIN1a::GFPcontainingtheOsPIN1ageneandacodinggreenfluorescentprotein(gfp)genewasconstructed.ThefusionvectorwastransferredintoonionepidermalcellsbyAgrobacteriumtumefacienstransformation.ThetransientexpressionofOsPIN1a-GFPwasmainlylocatedinthenucleusandcellmembrane.Moreover,thetransgenicplantswereobtainedbyAgrobacterium-mediatedgenetictransformation.MoleculardetectionperformedbyusingPCRandβ-glucuronidasestainingshowedthatthetargetconstructwasintegratedintothegenomeofrice.Thenegativephototropiccurvaturesofthetransgenicricerootswerehigherthanthoseofthewildtype.Similarly,theexpressionlevelsofOsPIN1ainthetransgenicplantswereconsiderablyhigherthanthoseinthewild-typeplants.TheseresultssuggestthatOsPIN1aiscrucialinthenegativephototropiccurvatureofriceroots.

  • 标签: RICE OsPIN1a green FLUORESCENT protein TRANSIENT
  • 简介:Membersoftheactivityofbc1complex(ABC1)familyareproteinkinasesthatarewidelyfoundinprokaryotesandeukaryotes.PreviousstudiesshowedthatseveralplantABC1genesparticipatedintheabioticstressresponse.Here,wepresentthesystematicidentificationofriceandArabidopsisABC1genesandtheexpressionanalysisofriceABC1genes.Atotalof15and17ABC1genesfromthericeandArabidopsisgenomes,respectively,wereidentifiedusingabioinformaticsapproach.Phylogeneticanalyseso...

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  • 简介:米饭镉(Cd)敏感变异的cadB-1用Agrobacteriumtumefaciens被获得调停的系统。在cadB-1和野类型(WT)的暴露以后米饭幼苗到为有增加外部Cd集中的cadB-1和WT的10d,在根积累到高水平的Cd,茎和叶子的Cd集中的一个范围,并且在cadB-1的幼苗生长的抑制比在WT更严肃。氢过氧化物累积在cadB-1的叶子和根是更高的。减少的谷胱甘肽(GSH)的比率/oxidized谷胱甘肽(GSSG),ascorbate(ASC)/dehydroascorbate(DHA)和减少的菸碱腺嘌dinucleotide磷酸盐(NADPH)/oxidized菸碱腺嘌dinucleotide磷酸盐(NADP+)在高Cd层次下面在叶子和根两个都比在WT在cadB-1是更低的。ascorbateperoxidase(APX)的活动,谷胱甘肽peroxidase(GR),dehydroascorbatereductase(DHAR)和monodehydroascorbatereductase(MDHAR)在Cd的高水平的处理下面在叶子和根两个都比在WT在cadB-1是也更低的。我们的结果建议在Cd应力下面,ASC-GSH周期更严重比在WT在cadB-1被禁止,显示变异的cadB-1不太能清除反应的氧种类并且对Cd敏感。

  • 标签: 脱氢抗坏血酸还原酶 还原型谷胱甘肽 镉(CD) 水稻幼苗 突变体 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸
  • 简介:一个实验被进行用荧光灯的微分显示器(软式磁碟机)方法在干旱应激和正常条件下面在米饭叶子和根比较信使rna表达式差别。一积极碎片被H.A的联合孤立黄页(contained0.1%H.A。黄)分离和宏数组屏蔽方法。比作ArabidopsisthalianaNADPH氧化还原酶基因,它有96%身份。cDNA是1423bp,并且包含了与345氨基酸残余编码蛋白质的1048bp的一个完全的开的读物框架。而且,基因表示水平在正常条件下面比那在干旱应激下面是更高的。在干旱反应下面的NADPH氧化还原酶基因的可能的角色也被讨论。

  • 标签: 水稻 干旱压力 还原型辅酶II类氧化还原酶基因 克隆化 基因表达
  • 简介:到在米饭germplasm91-1A2的米饭胆量小蚊的抵抗被识别并且遗传上分析了。米饭人口的F1s从作为一个男父母与米饭材料Jinggui,TN1,W1263(Gm1),IET2911(Gm2),BG404-1(gm3),OB677(Gm4),ARC5984(Gm5)和Duokang1(Gm6)交叉的91-1A2被导出。到米饭胆量小蚊的所有父母线和F1,BC1F1和F2人口的抵抗被识别。结果证明91-1A2和所有F1s对中国米饭胆量小蚊遗传因子型IV抵抗。到在BC1F1和F2的易受影响的抵抗植物的分离比率被X2测试与1:3和9:7规则给予,建议到中国米饭胆量小蚊遗传因子型IV的91-1A2的抵抗被是新抵抗基因的二主导的基因控制,对已知的米饭胆量小蚊抵抗基因非突变而产生之遗传因子。

  • 标签: 水稻种质 遗传分析 稻瘿蚊 抗性鉴定 显性基因控制 F2群体
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  • 简介:我们识别了米饭花的机关发展异种,称为的同样开的壳和男性无菌1(ohms1),从indicarestorer线的子孙,Zhonghui8015与60Co光线照耀对待。ohms1异种展出了开的壳并且像词根并且象palea一样组织在花药和耻辱之间的变换,它导致了显示出‘tridentatelemma’的ohms1异种小穗状花小穗。ohms1异种是完全无菌却有的60%-70%肥沃的花粉。印射的基因分析和基因证明ohms1被单个后退的基因控制,并且变异的基因对在标记KY2和KY29之间的染色体3的短手臂上的42-kb间隔印射罚款。在这个区域的四个开的读物框架的顺序分析表明异种在第五intron的最后底带了单个核苷酸转变(到G的A),它多半被通信到ohms1phynotype,在一种MIKC类型疯盒子的基因OsMADS1(LOC_Os03g11614)。进一步定序的酶消化和cDNA显示可变拼接在MADS领域或氨基酸框架为在ohms1,而是没有结构的变化的第六exon的删除负责移动出现了。另外,即时荧光灯量的PCR分析证明OsMADS1表示水平在ohms1异种显著地减少了。发展相关的基因也显著地改变了的米饭flowering因素和花的颖的表示层次。这些结果证明OsMADS1可以在米饭起一个重要作用花的机关开发,特别地在花的颖开发和小花原基区别。

  • 标签: 不育水稻 雄性不育 剪接因子 开颖 MADS-BOX基因 花器官发育