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  • 简介:为丰富太子分子标记库、开发太子SSR标记、寻找有效的太子种源鉴定方法。本研究运用MISA、Primer3等分子生物学分析工具,从太子转录组中搜索获得11297个SSR位点,其出现频率为8.87%,分布距离为平均每10kb有1.47个SSR位点,其中主要重复类型是单核苷酸重复;11297个SSR位点中不同核苷酸基序类型的SSR有259种,主要以单核苷酸重复基序A/T为主,其次是三核苷酸重复基序AAT/ATT。在此基础上设计、筛选得到16821对特异性引物,其中针对高多态性SSR序列的引物有8706对,随机挑选其中的20对引物对来源于贵州、江苏、福建的6个太子样品DNA进行PCR扩增,其扩增成功率达70%~80%。太子转录组SSR分布密度大、类型丰富、多态性潜能高、通用性好,可为开发太子功能性标记提供前期基础,在太子种质资源评价和优质种源筛选等方面具有极大的开发价值和良好的应用前景。

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