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5 个结果
  • 简介:TheaimofthisstudyistoexplorethegenomicmolecularorganizationandgenogroupofhumannorovirusfrominfectedinfantsinGuangzhouofChina.PrimersweredesignedaccordingtothegenomicsequenceofnorovirusintheGenBank,andthenorovirusgenomewasamplifiedbyRT-PCR.ThePCR-productswereclonedintoTvectorandsequenced,andthegenomicnucleotidesequenceswereanalyzedwiththeprogramsCLUSTALW/X,DNASTARandRAT(RecombinationAnalysisTool).TheNVgz01straingenomeis7558bpinlengthandencodesthreeopenreadingframes(GenBankaccessionNo.isDQ369797).ThegenomicsequencesofNVgz01werecomparedwiththoseofnomvirusinGenBank,whichrevealedthatthehomologywithgenogroupⅡrangesbetween76%-90%,andgenogroupⅠbe-tween43%-44%.TheORF1regionshared94%and88%identitywithMc37andFarmingtonstrains,respectively;thecapsidregion(ORF2)shared65%and94%identitywithMc37andFarmingtonstrains,respectively.Phylogenetictreeswerereconstructedbytheneighbor-joiningmethod.ComparativecompletesequenceanalysisoftheNVgz01withreportedhumannorovimsgenomicsequencesrevealedthatthisisolatebelongstogenogmupⅡ.TheORF1andORF2regionsshareddifferentidentitywithMc37andFarmingtonstrains,suggestingNVgz01couldbearecombinantvires.

  • 标签: 重组体 层序分析 基因组 基因表达
  • 简介:ToanalyzethegenomicmolecularstructureandgenotypeofhumanastrovirusisolatedfrominfantinGuangzhouofChina,theprimersweredesignedbasedonthegenomicsequenceofastrovirusfromtheGenBankandthetargetsequencewereamplifiedbyRT-PCR.ThenthePCR-productswereclonedtoTvectorandsequenced.ThegenomicnucleotidesequenceswereanalyzedbytheprogramsCLUSTALWandDNASTAR.ItwasfoundthatthefullgenomiclengthofHASTVgz01strainwas6721bpandtheORFswere6558bp.The5'and3'UTRwere82and81nucleotides.Thegenomeincluded3openreadingframes(ORFs):ORF1a,ORF1bandORF2.The5'-terminalORF1astartedatnucleotide83andextendedtonucleotide2845.ORFlb(nt2785tont4332)overlapedORFlaby61nucleotides.The3'-terminalORF2beganatnucleotide4325andterminatedatnucleotide6640.ORF2had2316nucleotides.ComparedwithotherastrovirussequencesinGenBank,thehomologyoftheaminoacidsequenceofORF2ofHASTVgz01strainwiththatofserotype4was93%.Homologywithotherserotypesrangedfrom61%to70%.ThecompletenucleotidesequenceofastrovirusHASTVgz01strainisolatedfromGuangzhouinChinawas6721bpinlength,GenBankaccessionNO.DQ344027.ComparingtheORF2ofastrovirusHASTVgz01withtheknownsequencesoftypes1-8thehighesthomologywasserotype4(93%).ComparativesequenceanalysisoftheHASTVgz01ORF2withthereportedhumanastrovirussequencesrevealedthattheisolatedastrovirusbelongstogenotype(serotype)4.

  • 标签: 广州 人类星状病毒HASTVgz01株 基因型4 全基因组序列分析 急性胃肠炎
  • 简介:【摘要】目的 分析肥东县梅毒的流行病学特征,为制定梅毒防控措施提供重要的科学依据。 方法 流行病学“三间”分析的研究方法。 结果  2015-2020年肥东县共报告3239例梅毒,梅毒发病率总体呈上升趋势,六年发病率升幅为99.86%,六年各年度间报告发病率差异有统计学意义(χ2=213.904,P0.001);六年报告数居前六位的职业依次为农民、家务及待业、商业服务、离退人员、工人、其他,六种职业共报告病例3125例,占梅毒报告总数的96.48%;六年的地区分布中,居前十位的依次为店埠镇、撮镇镇、梁园镇、白龙镇、八斗镇、古城镇、石塘镇、长临河镇、牌坊乡、众兴乡,前十位总数为2531例,占六年发病总数的78.14%。 结论 2015-2020年肥东县梅毒发病率上升明显,升幅高达99.86%,说明我县梅毒疫情形势在较长时间内依然十分严峻,必需继续加大加强我县梅毒的防治工作,尤其要加强对高危人群的健康教育重点干预工作,即加强对梅毒性病防治知识的宣传,从而有效遏制梅毒的高流行状态。

  • 标签: 梅毒  流行病学  分析
  • 简介:摘要:目的 通过分析2015-2020年丽江市疫苗接种后疑似预防接种异常反应(AEFI)的发生特征,评估该市AEFI监测系统的运转状况及预防接种安全性。方法 收集2015-2020年所有疫苗AEFI报告个案和接种剂次数,采用描述性流行病学方法分析AEFI发生率。结果 全市报告发生AEFI的疫苗有27种,共报告个案818例,年均报告发生率为32.38/10万剂,以一般反应为主,无接种事故、疫苗质量事故报告。DTaP、MR、MPV-A疫苗AEFI报告病例数较多,非免疫规划疫苗报告发生率居高。男性发病高于女性,1岁内儿童报告数较多,发病集中在夏秋季。结论 全市AEFI监测系统运行良好,监测敏感性较高,但仍有进一步提升空间。接种安全性较高,以一般反应为主,严重异常反应偶有发生,应加强对监护人接种知识宣教和接种人员业务培训,以此减少AEFI发生情况。

  • 标签: 疑似预防接种异常反应 疫苗 监测
  • 简介:[摘要 ] 目的:了解病毒性肝炎流行规律,为预防控制决策提供依据。方法:流行病学分析。结果:五年平均发病率为 40.03/十万,居法定报告传染病的第二位,男性( 454例)高于女性( 254例);甲型肝炎、乙型肝炎和其他肝炎(丙、丁、戊型和未分型病毒性肝炎,以下同)年均发病率分别为 2.96/十万、 32.22/十万和 4.86/十万,无丁型病毒性肝炎病例报告。结论:病毒性肝炎为昌宁县法定报告传染病的主要病种,呈现一定的季节性、地区性和病人群分类性分布特点。

  • 标签: 病毒性肝炎 疫情分析 综合防制