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  • 简介:摘要: 目的 基于网络药理学和分子对接探讨刺五加治疗结直肠癌作用机制 方法 利用Pubchem数据库和Swiss Target Prediction网络平台进行刺五加作用靶点预测;通过 GeneCards、OMIM、DiGseE 数据库获取治疗结直肠癌靶点蛋白,借助 Cytoscape 3.7.2 软件构建“刺五加-主要活性成分-结直肠癌靶点”网络图,并通过Degree值排名前10筛选核心成分;使用 STRING 平台进行蛋白质相互作用分析;采用 DAVID 数据库对刺五加治疗结直肠癌的作用靶点进行基因富集分析和通路富集分析;使用 AutoDock vina 软件对核心成分与关键靶点进行分子对接验证。 结果 刺五加治疗结直肠癌的主要活性成分为硬脂酸、山奈酚等;预测得到“刺五加-结直肠癌”AKT1、GAPDH、ALB、TNF、CTNNB1,5个关键靶点;基因富集分析得到GO功能条目1329个 (P<0.05),包括细胞成分184个、生物学过程695个、分子功能450个;KEGG通路富集得到信号通路195条(P<0.05);分子对接验证说明靶点与其成分的结合能较强。 结论 初步研究表明刺五加通过多成分、多靶点、多通路的方式调控和治疗结直肠癌,为研究中药刺五加治疗癌症的作用机制提供了科学依据和参考。

  • 标签: 刺五加 结直肠癌 靶点预测 网络药理学 分子对接
  • 简介:摘要 目的 通过网络药理学与分子对接验证,讨论北青龙衣治疗结直肠癌的潜在作用机制。方法 利用Pubchem和SwissTargetPrediction数据库对北青龙衣中的主要活性成分进行靶点预测;结直肠癌的主要靶点利用GeneCards、DisGenet和OMIM数据库获得;通过STRING数据库获得北青龙衣-结肠癌蛋白质相互作用网络图,筛选潜在的蛋白质功能;基于Cytoscape 3.9.1软件对北青龙衣主要活性成分-结直肠癌靶点网络图进行可视化分析;将北青龙衣与结肠癌的交集靶点导入DAVID数据库进行GO分析以及KEGG通路富集分析;最后采用Autoduck软件进行分子对接验证。结果 北青龙衣治疗结直肠癌的主要活性成分是Ellagic acid、Quercetin、Kaempferol等,相关的主要靶点包括AKT1,TNF,GAPDH,等。GO富集分析结果包括181条目细胞成分;1463条目生物学过程;415条目分子功能。KEGG通路富集分析结果表明,共富集到191条信号通路。以结合能≤−5.0 kcal/mol(-1.2 KJ/mol)为筛选标准,对北青龙衣成分与结直肠癌核心靶点蛋白进行分子对接验证,结果表明两者对接的结合能较强,证明北青龙衣是治疗结直肠癌的有效药物。结论 初步研究表明,北青龙衣通过多成分、多靶点、多通路调控结直肠癌,为中药调控结直肠癌提供理论基础。

  • 标签: 北青龙衣 结直肠癌 靶点预测 网络药理学 分子对接验证