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  • 简介:摘要目的分析宏基因组测序(mNGS)技术在重症肺炎病原菌未明患者中的应用价值。方法回顾性分析扬州大学附属医院2019年6月至2020年2月采用肺泡灌洗液mNGS技术辅助诊疗的重症肺炎病原菌未明患者8例的临床资料,包括肺泡灌洗液涂片、培养、mNGS检测等结果,分析患者的临床特点与mNGS检测情况。依据mNGS结果并结合临床医师的判断,将是否明确为病原菌分为病原菌确定组、病原菌未确定组,比较两组辛普森菌群多样性指数。结果8例患者中,男5例,女3例;年龄范围41~71岁,中位年龄62.5岁。除1例患者无慢性疾病外,其余患者合并糖尿病、慢性阻塞性肺疾病、肾脏移植等。8例患者mNGS检测阳性,3例患者常规检测阳性。病原菌确定组(n=5)与病原菌未确定组(n=3)辛普森菌群多样性指数比较,差异有统计学意义[(0.398±0.222)比(0.763±0.061),t=2.709,P=0.035]。2例患者mNGS检测阳性与常规检测阳性结果不同。3例卡氏肺孢子虫mNGS检测阳性患者的核酸序数为120~15 580,相对丰度为24.6%~99.8%。结论肺泡灌洗液mNGS技术有助于医师快速、全面掌握病原菌信息,特别适用于重症肺炎病原菌未明患者。

  • 标签: 基因组学 高通量核苷酸测序 肺炎 支气管肺泡灌洗液 血传病原体 诊断 治疗应用