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  • 简介:摘要目的建立实时荧光环介导等温扩增(Real-time Loop-mediated Isothermal Amplification,LAMP)技术检测皮肤的方法,实现皮肤病的快速实验室诊断。方法通过在NCBI官网查找下载皮肤属、小孢子属和表皮属临床分离率较高的菌种rRNA序列(18S rRNA, ITS1, 5.8S rRNA, ITS2和28S rRNA),运用DNASTAR Lasergene软件进行分析比对,寻找出属内高度保守的靶序列,且该段靶序列要与其他属存在差异,运用Primer Explorer V5设计LAMP引物。提取须NBRC6202基因组DNA作为模板筛选引物以及建立LAMP检测属的反应体系,以红色ATCC28188基因组DNA作为模板测试其敏感性和稳定性,以属以外的其他真菌、细菌基因组DNA验证LAMP反应体系的特异性。结果筛选的4套引物里,primer2的扩增效果较好,可在22 min检测出须,且可以特异地检测出红色、指间、许兰、紫色。本研究建立的属RT-LAMP检测方法的最低检测限为1 pg/μL;在10 000 pg/μL、100 pg/μL和1 pg/μL三个浓度的分别10次重复检测实验中平均CT值和CV%分别为9.24±0.30,3.29%、10.57±0.54,5.12%、15.95±0.52,3.24%。结论实验建立的属LAMP检测方法在特异性、敏感性和稳定性三方面均表现出优越的性能,能快速准确地检测出属常见菌种,具有良好的临床应用前景。

  • 标签: 实时荧光环介导等温扩增 皮肤癣菌 毛癣菌属 快速鉴定