简介：摘要目的探讨实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸在疾病诊断中的应用。方法从中国疾病预防控制信息系统选取截至2020年3月5日录入的河南省COVID-19的实验室检测数据和病例基本信息。所有信息都由当地医院和疾控中心录入系统，医院或者区县疾控中心负责采样，河南省各省辖市疾控中心负责核酸检测。结果共纳入6 714份标本，SARS-CoV-2核酸检测阳性率为23.82%。标本来源于3种诊断类型，确诊病例1 200例，疑似病例2 178例，无症状感染者77例，SARS-CoV-2感染核酸确诊率为36.96%(1 277/3 455)。所有诊断类型标本中，鼻拭子、痰液和咽拭子的SARS-CoV-2核酸检测阳性率分别为19.38%、28.59%、23.53%，差异有统计学意义(χ2＝15.896，P<0.01)。确诊病例的呼吸道标本SARS-CoV-2核酸检测阳性率为63.10%。鼻拭子、痰液和咽拭子的核酸阳性率分别为50.80%、58.71%、65.21%，差异有统计学意义(χ2＝18.612，P<0.01)。所有诊断类型发病后当天、1周、2周、3周、4周和5周及5周以上呼吸道标本SARS-CoV-2核酸检测阳性率依次为43.51%、23.98%、22.82%、12.17%、14.46%、13.21%，在确诊病例中的阳性率依次为89.03%、86.57%、52.30%、17.53%、17.69%和24.14%。结论实时荧光RT-PCR方法检测SARS-CoV-2核酸是最有效的早期病原学诊断方式，COVID-19发病后1周内核酸检出率最高，核酸检出时间最晚是发病后38 d。