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  • 简介:摘要目的分析2021—2022流行季北京市首起乙型流感Victoria系(BV)疫情病毒血凝素(HA)基因变异和进化特征以及与流感疫苗株匹配性。方法采集北京市朝阳区某小学乙型流感疫情流感样病例咽拭子标本,提取核酸利用二代测序技术进行测序分析。应用BioEdit分析HA基因核苷酸和氨基酸变异位点,采用Mega 6.0软件中NJ模式构建HA基因遗传进化树并分析。结果通过二代测序获得了2株BVHA基因全长序列。与本年度疫苗株HA基因相比较,疫情株有9个氨基酸位点发生变异,其中6个变异位点位于3个不同抗原决定簇。遗传进化树分析显示疫情株HA基因位于Clade 1A.3a2分支,与2021—2022度北半球推荐流感疫苗株(B/Washington/02/2019)不在同一分支。结论本起BV疫情毒株HA基因在抗原表位发生多处变异,必需加强BV流感监测与变异规律分析,为BV防控策略制定提供有力数据支撑。

  • 标签: 二代测序 乙型流感病毒 HA基因 基因变异
  • 简介:摘要目的掌握2021北京市流感流行特征乙型Victoria系(简称BV)流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因、抗原性变异情况,为北京市流感防控提供科学依据。方法北京市20211—11流感病原学监测结果进行统计分析,并随机抽取15株BV流感病毒,通过HA基因扩增测序,分析其基因变异和进化特征。结果研究期间共收集流感样病例样本16 097份,其中核酸检测阳性208份,经型别鉴定BV流感病毒205份(98.56%)、乙型Yamagata(简称BY)系流感病毒3份(1.44%)。15株BV流感病毒HA基因序列与疫苗株B/Washington/02/2019相比,核苷酸相似度为98.39%~98.75%,氨基酸相似度为97.86%~98.40%。基因进化分析显示15株BV流感病毒均分布于Clade1A.3a2分支,与疫苗株相比存在多位点变异。15株BV流感病毒有11个糖基化位点。1株(6.6%)为疫苗株低反应株。结论2021北京市监测到流感病毒中BV流感病毒占绝对优势,其HA基因位点多处发生变异,提示该亚型变异持续监测至关重要,为制定流感防控策略提供科学依据。

  • 标签: 乙型流感病毒 基因变异 进化分析 抗原性 疫苗株
  • 简介:摘要目的了解北京市儿童A族链球菌(GAS)M蛋白基因(emm基因)型别药敏特征变化。方法回顾性研究。收集2018、2019、2021北京市16区猩红热病原学监测哨点医院儿童临床诊断猩红热咽部感染病例咽拭子样本分离GAS菌株。采用PCR扩增测序进行emm基因分型,采用微量肉汤稀释法测定10种抗生素最低抑菌浓度(MIC)。采用χ2检验和Fisher′s确切概率法进行间比较。结果共收集GAS菌株557株,检测到11种emm基因型(emm1、emm3、emm4、emm6、emm11、emm12、emm22、emm75、emm89、emm128、emm212)。其中emm1型42.73%(238/557株),emm12型48.65%(271/557株),其他emm型8.62%(48/557株)。emm1、emm12、其他emm型2018分别为37.50%(105/280株)、57.14%(160/280株)、5.36%(15/280株);2019分别为49.05%(129/263株)、39.54%(104/263株)、11.41%(30/263株);2021分别为28.57%(4/14株)、50.00%(7/14株)、21.43%(3/14株)。2018和2019≤6岁儿童中感染emm12型构成比均高于>6岁儿童(62.50%比46.88%,46.36%比30.36%),差异均有统计学意义(χ2=7.182、6.973,均P<0.05)。选取225株GAS进行药敏检测,结果青霉素、左氧氟沙星、美罗培南、利奈唑胺、头孢噻肟、头孢吡肟、万古霉素7种抗生素敏感率均为100.00%,对红霉素、四环素、克林霉素耐药率分别为:201888.57%(93/105株)、87.62%(92/105株)、86.67%(91/105株);201994.34%(100/106株)、94.34%(100/106株)、87.74%(93/106株);20213种抗生素耐药率100.00%(14/14株)。2018青霉素MIC50、MIC90均为0.03 mg/L;2019分别为0.03 mg/L、0.06 mg/L;2021均为0.06 mg/L。225株GAS中207株存在耐药,且均为联合耐药,红霉素-四环素-克林霉素三重耐药占94.69%(196/207株),红霉素-克林霉素双重耐药占4.35%(9/207株),红霉素-四环素双重耐药占0.97%(2/207株)。结论北京市2018、2019、2021儿童GASemm基因型别多样,优势基因型为emm12与emm1,以emm12为主导流行型别。GAS菌株对红霉素、克林霉素、四环素维持较高耐药率,青霉素等抗生素保持敏感,但青霉素MIC50和MIC90呈递增趋势。

  • 标签: A族链球菌 emm基因 药敏试验 儿童