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  • 简介:摘要目的对比了解新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发生前及疫情期间广州市手足口病肠道病毒的分子流行病学特征。方法2019年1月至2021年12月,采集到于广州市妇女儿童医疗中心就诊的手足口病住院或门诊疑似患儿的标本共73 740份,其中2019年10 243份,2020年24 568份,2021年38 929份。采用实时荧光定量聚合酶链反应进行肠道病毒通用型、肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)、柯萨奇病毒A组(Coxsackie virus A group,CA)16检测,并选取EV71和CA16双阴性而肠道病毒通用型为阳性的标本进行型别鉴定。结果2019年10 243份同时进行肠道病毒通用型、EV71、CA16检测的手足口病标本中,肠道病毒通用型阳性6 590份(64.34%),EV71阳性37份(0.36%),CA16阳性1 107份(10.81%),非EV71非CA16肠道病毒阳性5 446份(53.17%)。2020年1 450份同时进行肠道病毒通用型、EV71、CA16检测的手足口病标本中,肠道病毒通用型阳性476份(32.83%),EV71阳性1份(0.07%,10月检测到),CA16阳性22份(1.52%),非EV71非CA16肠道病毒阳性453份(31.24%);仅进行肠道病毒通用型检测的23 118份标本中,阳性1 450份(6.27%)。2021年2 572份同时进行肠道病毒通用型、EV71、CA16检测的手足口病标本中,肠道病毒通用型阳性1 155份(44.91%),EV71全年未检出,CA16阳性219份(8.51%),非EV71非CA16肠道病毒阳性936份(36.39%);仅进行肠道病毒通用型检测的36 357份标本中,阳性5 938份(16.33%)。非EV71非CA16肠道病毒的序列分析确定有14种型别,其中CA6和CA10占44.14%(49/111)。结论COVID-19疫情期间的2020年和2021年的肠道病毒阳性率低于疫情前的2019年。2019年至2021年手足口病的病原体以非EV71非CA16肠道病毒中的CA6和CA10为主。

  • 标签: 手足口病 肠道病毒 流行病学 非EV71非CA16肠道病毒 型别分析 新型冠状病毒肺炎疫情
  • 简介:摘要目的探讨含胍盐病毒灭活保存管对提高2019新型冠状病毒核酸检测安全性和准确性的作用。方法以2020年2月广州市妇女儿童医疗中心4例确诊患儿的10份经本院新型冠状病毒核酸检测结果为阳性的标本作为研究对象,分别使用含胍盐灭活保存管和某品牌病原运送管的保存液洗脱后分装,在室温条件下分别放置12 h、24 h和48 h,然后转至-80℃冰箱保存至检测。比较两组样本qPCR结果,并进行统计学分析。结果同样病毒量放入两种不同的取材管处理,立即进行qPCR,含胍盐的灭活管核酸检出量更高。在病毒高载量标本中,两种取材管在不同时间段的检测结果相关性较高,灭活保存管的CT值更小,室温放置24 h后,结果差异均具有统计学意义(P<0.05);在病毒载量中等的标本中,两种取材的测量结果差异不具有统计学意义(P>0.05),但测量结果均随时间变化而变化,病毒灭活保存管组扩增曲线更早出现,CT值更小;当检测病毒低载量样本时,两组扩增结果有较大的差异(24 h后P<0.01),灭活保存管在放置时间24 h内均能检测出阳性结果,而病原运送管结果不稳定,仅在较短放置时间内能够检测出阳性结果。灭活保存管组的检出率要比病原运送管组的高,三个基因靶点检测的重复性更好,显示具有更强的病毒核酸的保存能力。结论在冠状病毒核酸检测采样时,使用含胍盐的病毒灭活保存取材管,一方面可以在取材后立即灭活病毒,大大降低实验室暴露感染的危险,并能实现样本的室温保存和运输,减低转运成本,利于基层单位的送检,另一方面,能维持病毒核酸的稳定性,使低拷贝数的病毒更容易被检出,减少假阴性,对保证新型冠状病毒核酸检测的准确性有积极意义。

  • 标签: 新型冠状病毒 病毒灭活 核酸检测 实时荧光定量PCR