简介：摘要目的检测长链非编码RNA LINC01235在胃癌细胞系中的表达并观察LINC01235对胃癌细胞迁移和侵袭的影响。方法采用Transwell小室法及划痕实验检测LINC01235对胃癌细胞迁移和侵袭能力的影响。应用蛋白质印迹法(Western blot)检测过表达LINC01235后上皮-间充质转化(EMT)关通路蛋白的表达变化。结果划痕实验显示，敲低LINC01235的实验组在划痕48 h后迁移距离显著短于对照组。Transwell实验显示，敲低LINC01235的实验组在24 h内穿膜细胞数量显著低于对照组(48.000±4.619比156.300±4.096，P<0.05)。蛋白质免疫印迹结果显示，过表达LINC01235的表达后，EMT通路相关蛋白N-钙黏蛋白及基质金属蛋白酶-2的表达水平随之升高。结论LINC01235具有促进胃癌细胞迁移和侵袭的作用。

简介：摘要目的检测长链非编码RNA FOXD3-AS1(lncRNA FOXD3-AS1)在乳腺癌中的表达并观察lncRNA FOXD3-AS1对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响。方法利用生物信息学的方法对肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌中的表达量进行分析，应用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术检测lncRNA FOXD3-AS1在10例乳腺癌及癌旁正常组织的临床样本及细胞系中的表达。细胞计数试剂盒(CCK-8)、5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷(EdU)细胞增殖检测试剂盒及集落形成实验检测敲低lncRNA FOXD3-AS1组和阴性对照组细胞增殖能力。Transwell小室法及划痕实验检测检测敲低lncRNA FOXD3-AS1组和阴性对照组细胞迁移和侵袭能力。配对样本采用配对样本t检验，或独立样本t检验。结果TCGA数据库分析结果显示lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌组织中表达明显升高[0.860(0.152～2.451)比0.032(0.015～0.078)，P<0.01]。在10例乳腺癌及癌旁正常组织的临床样本中，利用RT-qPCR结果验证lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌组织中高表达(t＝9.297，df＝9，P<0.01)。CCK-8实验及EdU实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组细胞的增殖活力明显低于阴性对照组[(15.2±0.93)%比(43.17±1.17)%，P<0.01]；克隆形成实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组细胞的克隆形成能力显著低于阴性对照组[(26.33±2.40)个比(66.33±3.28)个，P<0.01]。Transwell迁移实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组的细胞穿膜数量显著低于阴性对照组[(93.67±2.33)个比(170.3±3.48)个，P<0.01；(30.67±1.76)个比(103.00±3.79)个，P<0.01]；划痕实验显示敲低lncRNA FOXD3-AS1组细胞较阴性对照组细胞更慢的靠近划痕区域(24 h，t＝6.149，df＝12，P<0.01；48 h，t＝7.938，df＝12，P<0.01)。结论lncRNA FOXD3-AS1在乳腺癌中高表达，并具有促进乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的能力。

简介：摘要目的探讨转录因子激活增强子结合蛋白4(TFAP4)在胃癌中对LINC01235表达的调控作用。方法通过生物信息学分析，获取TFAP4可在胃癌中调控的LINC01235。采用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测在胃癌细胞中敲低TFAP4后LINC01235的表达变化。应用染色质免疫共沉淀(ChIP)法验证TFAP4可以结合LINC01235的启动子区域调控其转录。采取双荧光素酶报告实验计算相对荧光活性验证启动子区域的单核苷酸多态性(SNP) rs34667091可以促进转录。对独立样本采用t检验。结果肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中胃癌RNA-seq数据进行分析，可见LINC01235的高表达与不良预后明显相关(P<0.01)。JASPAR网站预测TFAP4可以调控LINC01235的表达。在胃癌细胞系中敲低TFAP4的表达后，LINC01235的表达水平随之降低。ChIP实验结果显示，与阴性对照组IgG比较，TFAP4与LINC01235的启动子区域结合富集百分比较高(0.000 299±2.129e-005比0.001 249±1.985e-005，t＝32.640，P<0.01)，差异有统计学意义。双荧光素酶报告实验结果显示，与正常对照组比较，LINC01235启动子区域的SNPs缺失后，TFAP4与启动子区域结合的相对荧光活性降低(1.000±0.207比0.341±0.031，t＝3.151，P<0.05；1.000±0.156比0.157±0.042，t＝5.221，P<0.05)，差异均有统计学意义。结论LINC01235的表达水平在胃癌中和不良预后呈正相关，TFAP4可以调控LINC01235的转录，LINC01235的启动子区域的SNP rs34667091可作为增强子。

简介：摘要目的探讨转录因子激活增强子结合蛋白4(TFAP4)在胃癌中的表达及对预后的影响，并观察TFAP4在胃癌细胞迁移和侵袭过程中发挥的作用。方法通过生物信息学分析，获取TFAP4在胃癌中的表达及在胃癌患者的预后中所起到的作用。采用Transwell小室法及划痕实验检测TFAP4对胃癌细胞迁移和侵袭能力的影响。应用蛋白质印迹法(Western blot)检测敲低TFAP4后上皮-间充质转化(EMT)相关通路蛋白的表达变化。对独立样本采用t检验。结果基因表达谱交互分析(GEPIA2)网站对胃癌组织的RNA测序(RNA-seq)数据进行分析，结果显示TFAP4在胃癌组织中高表达(t＝32.070，P<0.01)，差异有统计学意义。生存分析(KM-PLOTTER)网站对TFAP4进行生物信息学分析，TFAP4为胃癌预后的危险因素。划痕实验结果显示，敲低TFAP4的实验组在划痕48 h后相较于对照组迁移距离更短。Transwell实验结果显示，敲低TFAP4的实验组在24 h内穿膜细胞数量显著低于对照组[(83.000±3.786)个比(186.700±4.055)个，t＝18.690，P<0.05]，差异有统计学意义。Western blot结果显示，敲低TFAP4的表达后，上皮间充质转化(EMT)通路相关蛋白N-钙黏蛋白及基质金属蛋白酶(MMP)-2的表达水平随之降低。结论TFAP4在胃癌中高表达，和不良预后呈正相关，具有促进胃癌细胞迁移和侵袭的作用。

简介：摘要目的探讨三阴性乳腺癌中长链非编码RNA(lncRNA) CARMN的表达及其与患者生存期的关系，观察CARMN对乳腺癌细胞增殖的影响。方法通过肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中三阴性乳腺癌患者癌与癌旁组织样本配对分析差异表达的lncRNA。选取lncRNA CARMN利用Kaplan-Meier Plotter数据平台分析与患者预后的关系。细胞计数试剂盒(CCK-8)实验和克隆形成实验检测CARMN对乳腺癌细胞系的增殖的影响。配对样本采用配对t检验或Wilcoxon符号秩检验。结果TCGA数据库筛选出12个符合要求的lncRNA，其中CARMN在三阴性乳腺癌组织较癌旁组织表达明显下降(6.21±1.56比10.40±1.31，t＝11.208，P<0.05)。Kaplan-Meier生存曲线显示在基底细胞样型乳腺癌中，CARMN高表达与较好的无复发生存率有关[风险比(HR)＝0.53，95%可信区间(CI)：0.38～0.73，P<0.05]。CCK-8实验显示过表达CARMN可以抑制MDA-MB-231和BT-549细胞增殖；克隆形成实验显示过表达CARMN的MDA-MB-231和BT-549的克隆形成能力明显低于阴性对照组(63.3±4.0比175.0±5.6、32.7±5.5比49.3±5.9，t＝-6.607、-4.195，P<0.05)。结论lncRNA CARMN在三阴性乳腺癌中表达下调，提示不良预后，并可抑制三阴性乳腺癌细胞的增殖能力。

简介：摘要目的探讨长链非编码RNA(lncRNA) CARMN对三阴性乳腺癌多柔比星敏感性的影响及可能作用机制。方法瞬时转染CARMN过表达质粒后，通过细胞计数试剂盒(CCK-8)检测多柔比星对乳腺癌的抑制率。通过StarBase数据库预测CARMN可能下游分子，并筛选RAD51作为下游靶基因。采用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)及免疫印迹法对CARMN在乳腺癌细胞系的表达量、CARMN过表达质粒的转染效率和RAD51的mRNA及蛋白表达改变进行检测，探讨CARMN影响三阴性乳腺癌对多柔比星敏感性的可能机制。配对样本采用配对t检验。结果CARMN在三阴性乳腺癌细胞系MDA-MB-231、BT-549、BT-20、MDA-MB-468中较正常乳腺上皮细胞系MCF-10A表达下降(分别为0.032±0.005、0.524±0.044、0.367±0.783、47.448±6.929)。体外药物敏感性研究显示CARMN可以提高癌细胞对多柔比星的敏感性：在MDA-MB-231和BT-549细胞系中，过表达组多柔比星的抑制率均低于阴性对照组(t＝-9.042、-10.217，P<0.05)；药物作用72 h时过表达组的半数抑制浓度(IC50)均低于对照组(MDA-MB-231：1.43 μmol/L比2.32 μmol/L；BT-549：228.00 nmol/L比375.78 nmol/L，t＝-3.402、-3.624，P<0.05)。RAD51在CARMN过表达组的mRNA[MDA-MB-231 (25.59±1.52比77.19±7.08)、BT-549 (4.54±0.52比77.03±10.96)]和蛋白水平均明显下降(t＝-12.352、-8.864，P<0.05)。结论lncRNA CARMN可提高三阴性乳腺癌对多柔比星的敏感性，可能通过抑制DNA损伤修复相关因子RAD51的表达来实现。