评价农村中小学现代远程教育工程的成败最重要的指标并不是是否拥有现代远程教育项目和设备，而是它的应用效益，确保应用效益的首要条件是管理，然而，在农村中小学现代远程教育工程的管理与应用中却存在着五大难题，一是制度不健全，难以确保设备用于正常接收资源；二是硬件不是，难以保证每个教师都应用远程教育资源；三是教师对每天接收的学科资源不了解，难以保证教师合理地选用资源；四是教师掌握现代教育技术的程度不一，难以营造应用远程教育资源的校园氛围；五是思想观念没有更新，难以形成应用远程教育资源的内在动力，这不仅浪费了国家的财务和物力，而且教师没有从远程教育资源上接收到先进的教育理念和与时俱进的教育方法，更重要的是学生无法享受优质教育资源，无法从优质资源中获得良好的教育。
