摘要
摘要目的分析整合素α3(ITGA3) mRNA和蛋白在不同级别、临床及分子特征脑胶质瘤组织、细胞系之间表达的差异,探讨其对脑胶质瘤患者预后的评估价值。方法(1)分别从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和中国脑胶质瘤图谱(CGGA)数据库提取脑胶质瘤ITGA3 mRNA的表达数据和患者的临床资料。比较不同世界卫生组织(WHO)分级、年龄、性别、异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态、染色体1p/19q缺失状态脑胶质瘤间ITGA3 mRNA表达的差异。采用Kaplan-Meier法绘制并比较ITGA3 mRNA高表达组、ITGA3 mRNA低表达组患者的生存曲线。受试者工作特征(ROC)曲线分析ITGA3 mRNA对患者生存率的预测效能。单因素和多因素Cox回归分析明确患者预后的独立影响因素。将预后的独立影响因素构建列线图,应用校准图来验证列线图预测患者预后的可靠性。(2)通过人类蛋白质图谱(HPA)在线数据库测定ITGA3的细胞内定位和低、高级别脑胶质瘤中ITGA3蛋白表达。(3)体外培养脑胶质瘤细胞U87、U118、U251和人星形胶质细胞SVG,采用Western blotting、RT-PCR分别检测各细胞中ITGA3 mRNA和蛋白的表达。结果(1)TCGA数据库中,WHO分级Ⅱ、Ⅲ级、Ⅳ级胶质瘤ITGA3 mRNA的表达依次增加,差异有统计学意义(P<0.05)。CGGA数据库中,WHO分级Ⅳ级胶质瘤ITGA3 mRNA的表达高于Ⅱ级、Ⅲ级胶质瘤,差异有统计学意义(P<0.05)。TCGA和CGGA数据库中,≤40岁和>40岁、IDH野生型和IDH突变型、染色体1p/19q缺失和无缺失患者间胶质瘤ITGA3 mRNA表达的差异均有统计学意义(P<0.05)。无论是总体胶质瘤,还是低级别胶质瘤和胶质母细胞瘤中,ITGA3 mRNA低表达组患者的生存率均高于ITGA3 mRNA高表达组,差异均有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析显示:TCGA数据库中ITGA3 mRNA预测脑胶质瘤患者1、3、5年生存率的曲线下面积(AUC)分别为0.791、0.786、0.708。CGGA数据库中ITGA3 mRNA预测脑胶质瘤患者1、3、5年生存率的AUC分别为0.661、0.667、0.659。TCGA数据库中多因素Cox回归分析显示年龄、WHO分级、IDH突变、染色体1p/19q缺失及ITGA3 mRNA(HR=1.018,95%CI:1.006~1.030,P=0.003)为脑胶质瘤患者预后的独立影响因素(P<0.05)。CGGA数据库中多因素Cox回归分析显示WHO分级、IDH突变、染色体1p/19q缺失及ITGA3 mRNA(HR=1.445,95%CI:1.132~1.844,P=0.003)为脑胶质瘤患者预后的独立影响因素(P<0.05)。列线图显示年龄因素对患者生存率的影响最大,ITGA3 mRNA次之。校准图显示列线图预测胶质瘤患者1、3、5年生存率的可靠性较高。(2)ITGA3蛋白主要位于脑胶质瘤细胞的细胞膜和囊泡,且高级别脑胶质瘤组织中ITGA3蛋白的表达明显高于低级别脑胶质瘤组织。(3)Western blotting、RT-PCR检测结果显示U87、U118、U251细胞中ITGA3蛋白和mRNA表达量均明显高于SVG细胞,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论ITGA3 mRNA和蛋白的表达与脑胶质瘤的恶性程度有关,ITGA3 mRNA低表达患者生存率较高,ITGA3 mRNA可以作为脑胶质瘤患者预后的评估指标。
出版日期
2022年12月13日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)