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  • 简介:单个核苷酸型性(SNP)是决定任何二个无关个人之间差别的基因变化。各种各样的人口组能用SNP对方被区分开来。例如,HapMap数据大约1000万SNP有四个人口组。为人进化,种族变化,和人口赋值上更多卓见,我们建议发现哪个SNP决定人口组是重要然后作为输入特征用这些相关SNP分类不同人口。在这研究,我们开发了评价措施修改t测试并且把它用于HapMap遗传型数据。第一,我们赋值包括F统计和增进知识海角另外特征重要性措施比较评价所有SNP。第二,我们作为输入选择最高度评价SNP不同数字到一个分类器,例如支持向量机器,以便发现最好特征相应于最好分类精确性子集。试验性结果证明建议方法发现在决定人口组是重要SNP是很有效减少计算负担和更好分类精确性。

  • 标签: SNP SVM 基因型数据 统计方法
  • 简介:我们分析表示基因(transcriptomes)和翻译蛋白质(专业版--teomes)肌肉纸巾和激活CD4+和五种类型CD8+T淋巴细胞(T房间),2糖尿病(T2DM)用Affymetrix微数组和集体spectrometry使遭到,并且把他们匹配非糖尿病控制作比较。胰岛素受体(INSR)基因表达,维生素D受体,胰岛素降级酶,Akt,胰岛素受体substrate-1(IRS-1),IRS-2,葡萄糖transporter4(GLUT4),并且glycolytic小径酶被减少至少50%T2DM比控制。然而,有比血浆房间glycoprotein-1规定上面的双重基因大,肿瘤坏死因素(T2DMTNF,和gluconeogenic酶比控制。INSR或TNF基因silencing分别地导致了GLUT4抑制或刺激。相应于上述翻译transcriptomes分子重量Proteome侧面显示出在T2DM和控制之间变化不同模式。同时,在在肌肉和T2DM激活T房间之间transcriptomes和proteomes变化是可比较。激活T房间,类似于肌肉房间,表示胰岛素发信号和葡萄糖新陈代谢基因和基因产品。结论,T2DMT房间和肌肉相对非糖尿病控制某些基因和基因产品表示展出了差别。transcriptomes这些改变和在T2DMproteomes可以涉及胰岛素抵抗。

  • 标签: 淋巴细胞 激活作用 肌肉 2型糖尿病